ChIP-qPCR
- 转录因子团结位点判断
- 基因调控机制研究
- 疾病相关研究
- DNA与55402永利mg互作
效劳特色
通过ChIP-qPCR手艺，可以探索转录因子与基因调控元件的相互作用、研究染色质的结构和功效，以及相识基因表达的调控机制。
效劳先容
染色体免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是用来研究55402永利mg质与DNA是否在体内保存相互作用，这项手艺资助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会泛起何种组55402永利mg修饰。使用抗体抗原特异性团结，将与目的55402永利mg相团结的DNA片断沉淀下来，能够真实地反应团结在DNA序列上的调控55402永利mg。
效劳优势
- 高迅速度和特异性：能够准确丈量特定基因或区域的团结情形，具有较高的迅速度和特异性。
- 适用于小样本量：可以在少量样本的情形下举行剖析，适用于资源有限或样本稀缺的研究。
- 直接定量剖析团结位点的品貌：可以直接丈量团结位点的品貌，提供定量剖析的能力，可用于较量差别样本之间的差别。
- 特定基因或区域的剖析：可以针对特定基因或区域举行剖析，有助于深入研究感兴趣的团结事务。
- 可与其他实验手艺团结使用：如免疫共沉淀、Western blot等，以获得更周全的信息和验证效果。
效劳流程
客户提供
ChIP检测专用抗体。
送样要求：
离体后迅速超低温处置惩罚并-80℃冻存的组织样品，干冰运输。
细胞：只管提供细胞由我方作育，冰冻＞2x10^7个细胞 ；
组织：动物不少于1g，植物不少于4g。
最终交付
- 完整的实验报告、有代表性的图片、测序效果等原始数据。
效劳说明
| 效劳名称 | 效劳内容 | 交付内容及标准 | 效劳周期(事情日) |
| ChIP-qPCR | ChIP前55402永利mg提取+WB | 1个泳道 | 20 |
| ChIP富集 | 富集2次：IgG、IP各1次 | ||
| qPCR实验 | IgG，IP，input各1次 |
案例展示
常见问题与剖析 (Q&A)
染色质免疫共沉淀（ChIP）所获得的DNA产品，在ChIP-Seq中通过高通量测序的要领，在全基因组规模内寻找目的55402永利mg（转录因子、修饰组55402永利mg）的DNA团结位点片断信息 ；ChIP-qPCR需要预设待测的目的序列，针对目的序列设计引物，以验证该序列是否同实验55402永利mg团结互作。
相关资源
1、ChIP手艺的实验办法
● 交联：将细胞或组织交联，以牢靠55402永利mg质与DNA的相互作用。通常使用甲醛举行细胞或组织的交联。
● 细胞核提。航涣蟮南赴蜃橹傩邢赴颂崛，以获得染色质55402永利mg质复合物。
● DNA剪切：使用限制性酶、酶切酶或超声波等要领将染色质剪切成适当的片断。这样可以将特定55402永利mg质团结的DNA片断保存下来。
● 免疫沉淀：将剪切后的染色质55402永利mg质复合物与特定抗体举行免疫反应，使55402永利mg质与抗体团结。这样可以选择性地富集与特定55402永利mg质团结的DNA片断。
● 洗涤：将免疫沉淀复合物举行多次洗涤，以去除非特异性团结的DNA和其他杂质。
● 解交联：去除细胞或组织中的交联，使DNA片断恢复到原始的非交联状态。
● DNA纯化：从免疫沉淀复合物中纯化富集的DNA片断。这可以通过酚/氯仿提取、柱层析或商业DNA纯化试剂盒等要领完成。
● DNA剖析：对纯化的DNA片断举行进一步的剖析，如定量PCR、实时荧光PCR、测序或芯片芯片剖析等。
2、ChIP-qPCR手艺的应用
● 确定特定转录因子与基因启动子的团结：ChIP-qPCR可以用于验证特定转录因子与目的基因启动子的团结，从而确定转录因子对该基因的调控作用。
● 研究表观遗传修饰和染色质状态：ChIP-qPCR可以用于剖析特定表观遗传修饰标记（如组55402永利mg修饰）与染色质区域的团结情形，展现染色质状态和基因表达调控之间的关系。
● 验证转录因子团结位点的功效：通过ChIP-qPCR剖析差别转录因子团结位点的富集水平，可以确定这些团结位点在基因调控中的功效主要性。
● 研究疾病相关基因的调控：ChIP-qPCR可以用于研究疾病相关基因的调控机制，例如确定转录因子与致病突变基因的团结情形，相识其对基因表达的影响。
3、ChIP-qPCR手艺、ChIP-seq和ChIP-chip手艺的比照区别
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手艺 |
ChIP-seq |
ChIP-chip |
ChIP-qPCR |
| 看法 |
通过测序剖析确定55402永利mg质与染色质上特定 DNA序列的团结情形。 |
使用芯片手艺检测55402永利mg质与染色质上特定 DNA序列的团结情形。 |
使用定量PCR剖析55402永利mg质与染色质上特定 DNA序列的团结情形。 |
| 优势 | - 高通量剖析 |
- 适用于小样本量 |
- 高迅速度和特异性 |
| - 可全基因组规模的研究 |
- 成内情对较低 |
- 适用于小样本量 | |
| - 高迅速度和特异性 |
- 团结位点判断和剖析 |
- 特定基因或区域的剖析 | |
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- 不依赖先验知识 |
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- 团结位点判断和剖析 |
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| 劣势 |
- 数据剖析重大 |
- 有限的基因笼罩规模 | - 无法举行全基因组规模的研究 |
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- 需要大宗测序深度 |
- 需要先知道团结位点的区域 | - 仅限于已知的目的基因或区域剖析 | |
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- 依赖参考基因组的质量 |
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| 应用领域 |
- 转录因子团结位点判断 |
- 转录因子团结位点判断 | - 转录因子团结位点判断 |
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- 基因调控机制研究 |
- 表观遗传学研究 | - 基因调控机制研究 | |
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- 表观遗传学研究 |
- 疾病相关研究 | - 疾病相关研究 | |
| 举例 |
- 确定转录因子X团结位点在肿瘤细胞中的漫衍情形 |
- 剖析组55402永利mg修饰酶在差别发育阶段的团结位点 | - 研究转录因子Y在疾病模子中的团结位点转变 |
